旷工三天自动离职不发工资是不合法的。劳动者旷工的用人单位可以不支付劳动者未工作的劳动报酬，但是需要支付实际出勤天数的工资。若劳动者属于严重违反单位的规章制度的，可以依法解除劳动合同，并不支付经济补偿或赔偿。
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如果无法协商，申请劳动仲裁
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